Ученые срочно изучают новый индийский штамм COVID-19 из-за роста смертности
Потенциально опасный штамм коронавируса, обнаруженный недавно в Индии, возможно, не так опасен, как считалось.
Однако сегодня Индия сильно отстает в проведении массового тестирования, которое необходимо для отслеживания динамики распространения инфекции и лучшего понимания происходящего, сообщает Associated Press.
В понедельник Всемирная организация здравоохранения (далее – ВОЗ, МедОбоз) определила новую версию вируса B.1.617, который получил название "индийского" как "штамм, вызывающий беспокойство" вместо "штамм, требующий внимания".
Такие изменения в подходе были сделаны на основе предварительных исследований, после изучения тех штаммов, которые были впервые обнаружены в Великобритании, Южной Африке и Бразилии, но распространились на другие страны.
Имеющиеся данные показали, что этот штамм обладает более высокой степенью заразности, и может вызывать более тяжелые последствия для заболевшего. А применение антибиотиков для его лечения может вызвать так называемый "черный грибок" поражающий слизистые, в том числе в легких.
"Нам нужно гораздо больше информации об этом штамме вируса", - сказала Мария Ван Керхове, технический руководитель ВОЗ по COVID-19. Она настаивает на том, что для изучения нового штамма необходимо проведение секвенирования выявленных образцов. При секвенировании биополимеров (белков и нуклеиновых кислот — ДНК и РНК) штамма ученые получают дополнительную информацию, позволяющую глубже изучить этот новый подвид инфекции. "Нам нужно больше секвенирования, причем целевого, которое будет проведено не только в Индии, но и в других странах, чтобы мы знали, сколько этого вируса циркулирует".
Вирусы постоянно мутируют, и всплеск заражения в Индии привел к появлению новых возможностей для появления новых штаммов.
К сожалению, Индия слишком медленно начала генетический мониторинг, необходимый, чтобы увидеть, происходят ли эти изменения и делают ли они коронавирус более заразным или смертельным.
Новые штаммы также необходимо контролировать, чтобы увидеть, помогают ли мутации вирусу ускользнуть от иммунной системы, что может привести к повторным инфекциям или сделать вакцины менее эффективными. На данный момент ВОЗ подчеркнула, что вакцины против COVID-19 эффективны для предотвращения болезней и смерти людей, инфицированных "индийским" штаммом.
Индийские ученые говорят, что их работе препятствуют бюрократические препоны и нежелание правительства делиться жизненно важными данными. В Индии секвенируется лишь около 1% всех случаев заболевших, и не все результаты загружаются в глобальную базу данных геномов коронавируса.
Когда секвенирования недостаточно, появятся "слепые пятна", и еще больше тревожных мутаций могут остаться незамеченными, пока они не станут широко распространенными, сказала Алина Чан, научный сотрудник Института Броуд Массачусетского технологического института и Гарварда, которая отслеживает глобальные усилия по секвенированию.
Впервые обнаруженный в прибрежном штате Махараштра в прошлом году, новый вариант сейчас обнаружен в 27 обследованных штатах. Между тем количество случаев, впервые обнаруженных в Великобритании, снизилось в Индии за последние 45 дней.
Представители органов здравоохранения Индии предупредили, что еще слишком рано приписывать рост заболеваемости в стране исключительно новому штамму COVID-19. Эксперты отмечают, что распространение могло быть вызвано решением правительства не приостанавливать религиозные собрания и многолюдные предвыборные митинги.
Секвенирование было бессистемным во всем мире
Усилия по секвенированию в Индии были бессистемными. По словам Чана, страна загружает 0,49 последовательности на 1000 случаев в GISAID, глобальный проект по обмену данными по COVID-19. США, у которых были свои проблемы с генетическим мониторингом, загружают около 10 из 1000 случаев, в то время как Великобритания делает это примерно 82 на 1000 случаев.
В конце прошлого года правительственным учреждениям Индии было приказано покупать материалы для лабораторий где только можно. Это оказалось невозможным, поскольку все материалы для секвенирования были импортированы. Как сказал Анураг Агарвал, директор Института геномики и интегративной биологии, препятствия были серьезными, но его лаборатория смогла найти обходные пути и продолжить секвенирование.
Другие лаборатории этого не сделали, и ученые сказали, что это должно было произойти, когда Индия усилила секвенирование, потому что в то время число случаев уменьшалось.
"Даже после того, как 18 января начались федеральные усилия, объединившие 10 лабораторий, которые могут секвенировать 7500 образцов еженедельно, фактическая работа не началась до середины февраля из-за других логистических проблем", - сказал доктор Шахид Джамиль, вирусолог, возглавляющий научно-консультативную группу, консультирующую консорциум.
К тому времени количество случаев заболевания в Индии начало расти.
Джамиль сказал, что в Индии секвенировано около 20 000 образцов, но только о 15 000 было сообщено публично, поскольку в некоторых из них отсутствовали важные данные. По его словам, до конца прошлого месяца треть присланных образцов была непригодной для использования.
А теперь разразившийся вирус заразил многих сотрудников лабораторий, выполняющих эту работу.
"Многие из наших лабораторий сталкиваются с этой проблемой", - сказал он.